1. 學術事務組陳婌珍科長，負責籌劃辦理「2009年數理科學組學術評鑑會議」，整合院、所雙方工作內容，居中溝通協調9個單位承辦人員，協助處理困難，掌握辦理情形，使會議圓滿完成，著有績效，獲記功1次。
2. 生物化學研究所林中山簡任編審，負責督導生化所實驗室感染性醫療廢棄物理實驗廢液及生物醫療廢棄物業務專案稽核案，配合度及執行績效良好，辛勞得力，獲記嘉獎1次。
3. 細胞與個體生物學研究所王學恒編審，執行細生所實驗室感染性醫療廢棄物處理等事宜，並配合辦理本院98年委外清理實驗廢液及生物醫療廢棄物業務專案稽核案，配合度及執行績效良好，辛勞得力，獲記嘉獎1次。
4. 生物多樣性研究中心顏梅花組員，督導辦理生物多樣性中心實驗室感染性醫療廢棄物處理等事宜，並配合辦理本院98年委外清理實驗廢液及生物醫療廢棄物業務專案稽核案，配合度及執行績效良好，辛勞得力，獲記嘉獎1次。
5. 原子與分子科學研究所賴錦志技士，辦理原分所實驗室感染性醫療廢棄物處理等事宜，並配合辦理本院98年委外清理實驗廢液及生物醫療廢棄物業務專案稽核案，配合度及執行績效良好，辛勞得力，獲記嘉獎1次。
6. 物理研究所吳喜成技正，在物理所第二機房火災事故，於第一時間至現場疏散人員、淨空救災通道，指揮人員救災並協助消防人員進入火場進行救災工作，協助災後復原工作，圓滿達成任務，績效卓著，獲記功2次。
7. 物理研究所王裕鑫技士，在物理所第二機房火災事故，於第一時間至現場確認起火點，滅火搶救及疏散機房人員，協助安全通道淨空、支援救災工作及災後復原工作，圓滿達成任務，績效卓著，記功2次。
8. 物理研究所蘇子宣技士，在物理所第二機房火災事故，協助現場安全維護，並協助善後復原工作，辛勞得力，獲記嘉獎1次。
9. 物理研究所盛巧弟組員，物理所第二機房火災事故，協助現場支援及善後復原工作，辛勞得力，獲記嘉獎1次。
10. 總務組楊樹楠專員，物理所第二機房火災事故，協助處理切離高壓電力供應，讓事故不至影響其他單位，迅速確實安全達成任務，著有績效，獲記功1次。
11. 總務組林慶章技士，物理所第二機房發生火災事故，協助消防人員事後採樣，蒐集資料讓消防人員順利，獲記功1次。
12. 數學研究所郭玫玲編審，積極配合新修正「身心障礙者權益保障法」相關規定之執行，辦理身心障礙者之進用，使數學所進用身心障礙者之比例符合規定，圓滿達成任務，辛勞得力，獲記嘉獎1次。
13. 物理研究所盛巧弟組員，積極配合新修正「身心障礙者權益保障法」相關規定之執行，辦理身心障礙者之進用，使物理所進用身心障礙者之比例符合規定，圓滿達成任務，辛勞得力，獲記嘉獎1次。
14. 化學研究所李銘仙簡任編審，積極配合新修正「身心障礙者權益保障法」相關規定之執行，辦理身心障礙者之進用，使化學所進用身心障礙者之比例符合規定，圓滿達成任務，辛勞得力，獲記嘉獎1次。
15. 地球科學研究所宋鳳龍辦事員，積極配合新修正「身心障礙者權益保障法」相關規定之執行，辦理身心障礙者之進用，使地球所進用身心障礙者之比例符合規定，圓滿達成任務，辛勞得力，獲記嘉獎1次。
16. 資訊科學研究所蔡英梅組員，積極配合新修正「身心障礙者權益保障法」相關規定之執行，辦理身心障礙者之進用，使資訊所進用身心障礙者之比例符合規定，圓滿達成任務，辛勞得力，獲記嘉獎1次。
17. 生物多樣性研究中心許文良編審，積極配合新修正「身心障礙者權益保障法」相關規定之執行，辦理身心障礙者之進用，使生物多樣性中心進用身心障礙者之比例符合規定，圓滿達成任務，辛勞得力，獲記嘉獎1次。
18. 農業生物科技研究中心黃玉珍編審，積極配合新修正「身心障礙者權益保障法」相關規定之執行，辦理身心障礙者之進用，使農生中心進用身心障礙者之比例符合規定，圓滿達成任務，辛勞得力，獲記嘉獎1次。
19. 基因體研究中心王玫婷簡任編審，積極配合新修正「身心障礙者權益保障法」相關規定之執行，辦理身心障礙者之進用，使基因體中心進用身心障礙者之比例符合規定，圓滿達成任務，辛勞得力，獲記嘉獎1次。
20. 經濟研究所林麗華組員，積極配合新修正「身心障礙者權益保障法」相關規定之執行，辦理身心障礙者之進用，使經濟所進用身心障礙者之比例符合規定，圓滿達成任務，辛勞得力，獲記嘉獎1次。
21. 歐美研究所莊馨然組員，積極配合新修正「身心障礙者權益保障法」相關規定之執行，辦理身心障礙者之進用，使歐美所進用身心障礙者之比例符合規定，圓滿達成任務，辛勞得力，獲記嘉獎1次。
22. 社會學研究所洪莎鈺組員，積極配合新修正「身心障礙者權益保障法」相關規定之執行，辦理身心障礙者之進用，使社會所進用身心障礙者之比例符合規定，圓滿達成任務，辛勞得力，獲記嘉獎1次。
23. 法律學研究所籌備處余永玲組員，積極配合新修正「身心障礙者權益保障法」相關規定之執行，辦理身心障礙者之進用，使法律所籌備處進用身心障礙者之比例符合規定，圓滿達成任務，辛勞得力，獲記嘉獎1次。
24. 人文社會科學研究中心陳明志組員，積極配合新修正「身心障礙者權益保障法」相關規定之執行，辦理身心障礙者之進用，使人社中心進用身心障礙者之比例符合規定，圓滿達成任務，辛勞得力，獲記嘉獎1次。
25. 總務組林雪美技正，積極配合新修正「身心障礙者權益保障法」相關規定之執行，辦理身心障礙者之進用，使總務組進用身心障礙者之比例符合規定，圓滿達成任務，辛勞得力，獲記嘉獎1次。
26. 歷史語言研究所楊敏鈺組員，積極配合新修正「身心障礙者權益保障法」相關規定之執行，辦理身心障礙者之進用，使史語所進用身心障礙者之比例符合規定，圓滿達成任務，辛勞得力。
27. 會計室孫丕捷專員，承辦預算科綜合業務、本院一般行政、營建工程等科目概（預）算編製事宜，及彙編全院生命科學研究計畫相關概（預）算資料，認真負責。另配合行政院主計處、總統府會計處、立法院預算中心等，隨時提報本院99年度各項相關資料，並對主管臨時交辦事項，如期完成，著有績效，獲記功1次 。
28. 會計室楊蕙慈辦事員，辦理開發「中央研究院接受補助(委託)計畫原始憑證保管系統」，使專題計畫原始憑證採就地審計憑證管理，縮短作業時間，提昇行政效率。另辦理會計檔案管理，會計憑證整理及經費類憑證送審作業，工作績效良好，主管臨時交辦事項亦如期完成，辛勞得力，獲記嘉獎1次。
29. 學術事務組約聘人員張英朗先生，辦理「2009年數理科學組學術評鑑」工作，負責經費的編列簽報核銷、50多位國外委員通訊聯繫等工作。另辦理「年輕學者研究著作獎」，每年約有150多人申請，負責審議、頒獎及經費核銷，並協助英文文稿的修改及撰寫工作，績效良好，比照嘉獎2次。
30. 化學研究所約聘人員李若芸女士，負責化學所實驗室感染性醫療廢棄物處理等事宜，並配合辦理本院98年委外清理實驗廢液及生物醫療廢棄物業務專案稽核案，配合度及執行績效良好，辛勞得力，比照嘉獎1次。
31. 應用科學研究中心約聘人員陳怡君女士，負責應科中心實驗室感染性醫療廢棄物處理等事宜，並配合辦理本院98年委外清理實驗廢液及生物醫療廢棄物業務專案稽核案，配合度及執行績效良好，辛勞得力，比照嘉獎1次。
32. 生物化學研究所約僱人員洪振灃先生，執行生化所實驗室感染性醫療廢棄物處理等事宜，並配合辦理本院98年委外清理實驗廢液及生物醫療廢棄物業務專案稽核案，配合度及執行績效良好，辛勞得力，比照嘉獎1次。
33. 細胞與個體生物學研究所約聘人員簡書君女士，辦理細生所實驗室感染性醫療廢棄物處理等事宜，並配合辦理本院98年委外清理實驗廢液及生物醫療廢棄物業務專案稽核案，配合度及執行績效良好，辛勞得力，比照嘉獎1次。
34. 植物暨微生物學研究所約聘人員洪良銘先生，辦理植微所實驗室感染性醫療廢棄物處理等事宜，並配合辦理本院98年委外清理實驗廢液及生物醫療廢棄物業務專案稽核案，配合度及執行績效良好，辛勞得力，比照嘉獎1次。
35. 農業生物科技研究中心約聘人員黃彥程先生，辦理農生中心實驗室感染性醫療廢棄物處理等事宜，並配合辦理本院98年委外清理實驗廢液及生物醫療廢棄物業務專案稽核案，配合度及執行績效良好，辛勞得力，比照嘉獎1次。
36. 農業生物科技研究中心約聘人員游子慧女士，辦理農生中心實驗室感染性醫療廢棄物處理等事宜，並配合辦理本院98年委外清理實驗廢液及生物醫療廢棄物業務專案稽核案，配合度及執行績效良好，辛勞得力，比照嘉獎1次。
37. 生物多樣性研究中心約聘人員劉建華先生，辦理生物多樣性中心實驗室感染性醫療廢棄物處理等事宜，並配合辦理本院98年委外清理實驗廢液及生物醫療廢棄物業務專案稽核案，配合度及執行績效良好，辛勞得力，比照嘉獎1次。
38. 原子與分子科學研究所約聘人員劉載春女士，辦理原分所實驗室感染性醫療廢棄物處理等事宜，並配合辦理本院98年委外清理實驗廢液及生物醫療廢棄物業務專案稽核案，配合度及執行績效良好，辛勞得力，比照嘉獎1次。
39. 生物醫學科學研究所約僱人員李莉芳女士，協助辦理生醫所實驗室感染性醫療廢棄物處理等事宜，並配合辦理本院98年委外清理實驗廢液及生物醫療廢棄物業務專案稽核案，配合度及執行績效良好，辛勞得力，比照嘉獎1次。
40. 生物醫學科學研究所約聘人員李振家先生，協助辦理生醫所實驗室感染性醫療廢棄物處理等事宜，並配合辦理本院98年委外清理實驗廢液及生物醫療廢棄物業務專案稽核案，配合度及執行績效良好，辛勞得力，比照嘉獎1次。
41. 物理研究所約聘人員李國銘先生，物理所第二機房火災事故，協助現場安全維護，及善後復原工作，圓滿達成任務，辛勞得力，比照嘉獎1次。
42. 物理研究所特殊技能助理簡明宏先生，物理所第二機房火災事故，處理災後電腦清理恢復及網路設備運作，圓滿達成任務，辛勞得力，比照嘉獎1次。
43. 物理研究所特殊技能助理楊惠玲女士，物理所第二機房火災事故，處理災後電腦清理恢復及網路設備運作，圓滿達成任務，辛勞得力，比照嘉獎1次。
44. 物理研究所約聘人員施宏儒先生，物理所第二機房火災事故，處理災後電腦清理恢復及網路設備運作，圓滿達成任務，辛勞得力，比照嘉獎1次。
45. 物理研究所特殊技能助理謝璨隆先生，物理所第二機房火災事故，處理災後電腦清理恢復及網路設備運作，圓滿達成任務，辛勞得力，比照嘉獎1次。
46. 物理研究所約聘人員黃振維先生，物理所第二機房火災事故，處理電腦設備檢整與各項網格服務復原事宜，認真負責，圓滿達成任務，績效良好，比照嘉獎2次。
47. 資訊科技創新研究中心約聘人員施宏良先生，物理所第二機房火災事故，第一時間處置與疏散人員，並全力投入災後復原與機房重建工作，以最短時間內將WLCG Tier1與Tier2設施於院外機房設置恢復完成，並帶領同仁完成網路設施之清理復原，及規劃協助機房電腦設施之重整，圓滿達成任務，績效卓著，比照記功2次。
48. 資訊科技創新研究中心約聘人員褚昶銓先生，物理所第二機房火災事故，事發接獲斷電通知，立即進入機房察看，並配合消防隊滅火及現場搶救處置，事後全力投入機房復原與重建，圓滿達成任務，績效卓著，比照記功2次。
49. 資訊科技創新研究中心約聘人員李宏德先生，物理所第二機房火災事故，協助指揮同仁進行設備清理檢測與復原，支援網路設備異地重建與檢整，以及網路服務復原等事宜，減低設備損失，圓滿達成任務，著有績效，比照記功1次。
50. 資訊科技創新研究中心約聘人員陳信言先生，物理所第二機房火災事故，事發後主動協調搶修國際骨幹網路設備，並於第3天恢復正常服務，將損失與影響減至最低，同時積極配合機房復原作業，圓滿達成任務，著有績效，比照記功1次。
51. 資訊科技創新研究中心約聘人員洪銓鴻先生，物理所第二機房火災事故，事發生後搶修國際骨幹網路設備，並於第3天恢復正常服務，將損失與影響減至最低。同時配合機房異地重建與復原之網路建置檢測等作業，圓滿達成任務，績效良好，比照嘉獎2次。
52. 資訊科技創新研究中心約聘人員張慧怡女士，物理所第二機房火災事故，支援災後重建與復原相關之各項採購與公文書處理，圓滿達成任務，績效良好，比照嘉獎2次。
53. 資訊科技創新研究中心約聘人員黃慈慧女士，物理所第二機房火災事故，支援災後重建與復原相關之各項採購與公文書處理，圓滿達成任務，績效良好，比照嘉獎2次。
54. 資訊科技創新研究中心約聘人員李瑋琪女士，物理所第二機房火災事故，支援災後重建與復原相關之各項採購與公文書處理，圓滿達成任務，辛勞得力，比照嘉獎1次。
55. 天文及天文物理研究所籌備處特殊技能助理邱欣怡女士，負責天文所籌備處「高角解析度的毫米與次毫米天文學國際研討會」事前各項準備工作，計有19個國家，156位國家代表與會，與會人數達215人，共計發表176篇論文，規劃各項細節得宜，深受與會來賓讚許，圓滿達成任務，著有績效，比照記功1次。
56. 天文及天文物理研究所籌備處約聘人員林素蓮女士，負責天文所籌備處「高角解析度的毫米與次毫米天文學國際研討會」重大活動網站註冊作業設計及相關會議工作協調，即時提供網站最新訊息，提供查詢、下載，圓滿達成任務，績效良好，比照嘉獎2次。
57. 天文及天文物理研究所籌備處約聘人員蔡殷智先生，負責天文所籌備處「高角解析度的毫米與次毫米天文學國際研討會」重大活動網站美術設計及相關會議工作協調，圓滿達成任務，辛勞得力，比照嘉獎1次。
58. 天文及天文物理研究所籌備處特殊技能助理王貞純女士，協助辦理天文所籌備處「高角解析度的毫米與次毫米天文學國際研討會」講員及國外與會人員行程安排及簽證(旅行證)，圓滿達成任務，辛勞得力，比照嘉獎1次。
59. 天文及天文物理研究所籌備處特殊性約聘技術人員周益正先生，常於週末或休假期間，協助處理本院城中學人宿舍淹水、漏水情事，即時聯絡並監督廠商施作，使住戶災害損失減少，並協助事後各項聯繫事宜，績效良好，比照嘉獎2次。
60. 天文及天文物理研究所籌備處特殊技能助理陳俐秀女士，協助天文所籌備處採購事宜，推動採購流程電子化與財產及物品資料庫的建立，並自96年底協助籌劃建立採購線上系統，於97年初上線，97年完成506筆採購。另建立財產及物品Access資料庫及報表，方便線上查詢，提高行政效率，有效管理財產及物品，辛勞得力，比照嘉獎1次。
61. 統計科學研究所約聘人員姚怡香女士，積極配合新修正「身心障礙者權益保障法」相關規定之執行，辦理身心障礙者之進用，使統計所進用身心障礙者之比例符合規定，圓滿達成任務，辛勞得力，比照嘉獎1次。
62. 天文及天文物理研究所籌備處特殊技能助理廖容欣女士，積極配合新修正「身心障礙者權益保障法」相關規定之執行，辦理身心障礙者之進用，使天文所籌備處進用身心障礙者之比例符合規定，圓滿達成任務，辛勞得力，比照嘉獎1次。
63. 應用科學研究中心約聘人員邱香蘭女士，積極配合新修正「身心障礙者權益保障法」相關規定之執行，辦理身心障礙者之進用，使應科中心進用身心障礙者之比例符合規定，圓滿達成任務，辛勞得力，比照嘉獎1次。
64. 資訊科技創新研究中心約聘人員何月琪女士，積極配合新修正「身心障礙者權益保障法」相關規定之執行，辦理身心障礙者之進用，使資創中心進用身心障礙者之比例符合規定，圓滿達成任務，辛勞得力，比照嘉獎1次。
65. 植物暨微生物學研究所約聘人員李淑吟女士，積極配合新修正「身心障礙者權益保障法」相關規定之執行，辦理身心障礙者之進用，使植微所進用身心障礙者之比例符合規定，圓滿達成任務，辛勞得力，比照嘉獎1次。
66. 台灣史研究所約聘人員林詩倫女士，積極配合新修正「身心障礙者權益保障法」相關規定之執行，辦理身心障礙者之進用，使台史所進用身心障礙者之比例符合規定，圓滿達成任務，辛勞得力，比照嘉獎1次。
67. 語言學研究所約僱人員林雅雯女士，積極配合新修正「身心障礙者權益保障法」相關規定之執行，辦理身心障礙者之進用，使語言所進用身心障礙者之比例符合規定，圓滿達成任務，辛勞得力，比照嘉獎1次。
68. 物理研究所約聘人員鄧淑尹女士，承辦本院2009科技台灣探索(候鳥計畫)，執行及進度即時掌控，獲同仁及候鳥計畫學生們一致讚揚，圓滿達成任務，辛勞得力，比照嘉獎1次。
69. 物理研究所約聘人員林思育女士，協辦本院2009科技台灣探索(候鳥計畫)，執行及進度即時掌控，獲同仁及候鳥計畫學生們一致讚揚，圓滿達成任務，辛勞得力，比照嘉獎1次。
70. 人文社會科學研究中心約聘人員黃郁麟先生，多次協助候鳥計畫學員瞭解歷史人口計畫之內容及分析資料，並將複雜資料結構簡化，建置資料庫，圓滿達成任務，辛勞得力，比照嘉獎1次。
71. 會計室約聘人員曾華誼女士，承辦本院主題研究與人才培育科目概（預）算編製事宜，及彙編全院人文及社會科學研究計畫相關概（預）算資料，並辦理公務統計調查資料及各項報表編製，彙編全院年度歲出預算及保留分配數，積極負責，辛勞得力，比照嘉獎1次。
72. 會計室約聘人員王惠斐女士，辦理本院代收款系統、因公出國系統及主計人員人事資訊系統等管理維護相關業務，績效良好。另舉辦98年度會計人員座談會，並兼任會計室人事業務，認真負責，主管臨時交辦事項亦如期完成，辛勞得力，比照嘉獎1次。