行政院國家科學委員會為培育青年研究人員，獎助國家未來學術菁英長期投入學術研究，並紀念吳大猷先生對發展科學與技術研究之貢獻，自91年起辦理「吳大猷先生紀念獎」，獲獎人除獲頒獎牌外，另核給年度研究經費新台幣30萬元。95年度本院兩位獲獎人及其專題研究計畫如下：

1. 歷史語言研究所助研究員張谷銘之「現代博士論文成型的歷史：知識傳播的媒介、學術寫作的規範與現代學者的條件」
2. 中國文哲研究所副研究員陳瑋芬之「教育與愛國：容閎與新島襄思想的比較研究」