本院原分所倪其焜研究員、資創中心陳銘憲特聘研究員、分生所蔡宜芳研究員、簡正鼎研究員、生醫所林小喬特聘研究員、政治所吳重禮研究員、數學所林正洪研究員、統計所丘政民研究員、歐美所單德興研究員、基因體中心洪上程研究員及史語所李建民研究員共11人榮獲國科會98年度傑出研究獎。

行政院國家科學委員會為獎勵研究成果傑出之科學技術人才，長期從事學術或產學研究，以提升我國學術研究水準及國際學術地位，並強化我國產業技術研究成效及提升產業技術研發能力，增強國家科技實力，特設傑出研究獎。

該會每年遴選傑出人才，學術研究類每年以88名為限、產學研究類每年以5名為限，獲獎人由國科會頒發獎狀1紙，並發給連續3年之獎勵金，每人每年新臺幣30萬元。