第65屆教育部學術獎本院共2位研究人員獲獎，人文社會科學研究中心蕭高彥特聘研究員榮獲「社會科學類」、分子生物研究所薛一蘋特聘研究員則榮獲「生物及醫農科學類」獎項。

教育部學術獎頒贈對象為於國內積極從事學術研究，有重要貢獻或傑出成就並獲得學術界肯定者，每年舉辦一次。