細胞內DNA常呈現出多種不同結構的分子形式,其中有些結構形式非常複雜以至研究不易。然而為了要充分了解DNA和DNA之間相互作用的功能,以及其結構如何轉變的機制,實有必要去辨識這些不尋常的DNA結構的特徵。其中一個例子就是結構形式非常新穎的半環鏈體(hemicatenane)。此半環鏈體是經由兩股雙螺旋DNA中之兩個單鏈相互交叉緊扣結合而成的一個複合體。此複合體被認為是在DNA複製、修復和重組過程中形成的一個重要的中間體。由於取得此類結構的DNA非常困難,以至阻礙了對半環鏈體進行生物化學分析的研究。在這篇論文中,我們發現存在於一種超嗜熱古生菌(hyperthermophilic archaeum)內的第三類DNA拓樸異構酶(topoisomerase III)具有可以合成及解開半環鏈體的功能。這篇論文也顯示由人類的拓樸異構酶三甲(Top3α),Bloom症候群解旋酶(helicase)及其附屬之蛋白質Rmi1/Rmi2所形成的複合體有解開半環鏈體之生物化學作用的功能。此外,這項研究結果亦顯示出類型IA拓樸異構酶(type IA topoisomerases)可以調控半環鏈體結構的形成。這項發現將有助於進一步揭開DNA的結構與其功能之間關係的奧秘。
研究結果發表於美國國家科學院期刊
Synthesis and dissolution of hemicatenanes by type IA DNA topoisomerases.
Shun-Hsiao Lee, Grace Ee-Lu Siaw, Smaranda Willcox, Jack D. Griffith, and Tao-Shih Hsieh.
PNAS 2013; published ahead of print September 3, 2013, doi:10.1073/pnas.1304103110
The title, the complete list of authors, and the weblink for the paper is: http://www.pnas.org/content/early/2013/08/28/1304103110.abstract
此項研究係由細生所謝道時老師所領導研究團隊中之李順孝及蕭意如共同主導並為此論文之第一及第二作者。