本院生醫所施修明研究員、沈志陽研究員、資訊所廖弘源研究員、統計所程毅豪研究員、分生所鄭淑珍特聘研究員、語言所齊莉莎研究員、地球所林正洪研究員、史語所林富士研究員、政治所邱訪義副研究員、經濟所陳明郎研究員、化學所呂光烈研究員及數學所余家富研究員共12人榮獲國科會99年度傑出研究獎。

本獎項每年遴選傑出人才，學術研究類每年以93名為限、產學研究類每年以5名為限，獲獎人由國科會頒發獎狀1紙，並發給連續3年之獎勵金，每人每年新臺幣30萬元。