總統府2011年7月13日發布人事令，翁啟惠院長續任本院院長，任期由2011年10月19日至2016年10月18日。翁院長並敦請王汎森院士、彭旭明院士、陳建仁院士擔任副院長，分別輔佐人文社會科學組、數理科學組、與生命科學組之院務發展。本院並於2011年10月18日(星期二)上午9時30分在學術活動中心二樓平面演講廳，舉行院長續任暨新、卸任副院長歡迎、歡送茶會。

        在茶會中，翁院長闡述本院未來發展藍圖。他表示，承續本院先前所建立的堅實學術基礎，他將繼續帶領同仁，從兼顧人文關懷與科學發展的角度出發，追求學術卓越，使中研院成為具有特色及人才匯集的世界一流學術研究機構。具體發展方向包括：積極改善國內學術研發環境與制度，以吸引並培育更多研究與創新人才；順暢導引臺灣基礎學術研究與創新發展的銜接，以厚植國家發展能量；建置國家生技研究園區，以協助臺灣生技產業升級；推動國際合作，以與國際尖端學術密切接軌；提倡學術倫理自律與研擬利益衝突之規範；以及追求自然資源與人文社會之永續和諧發展等。

        翁院長同時對即將卸任的劉兆漢副院長及王惠鈞副院長盡心盡力地輔佐發展院務之辛勞與貢獻，表達至深敬意與謝意。

        劉兆漢副院長(1998年當選本院院士，副院長任期2006-2011)對促進本院國際學術交流與合作，以及培育高等研究人才之院務發展，貢獻甚多。他於副院長任內，積極營建本院與國內大學的合作氛圍，除持續加強本院國際研究生學程(TIGP)外，並與國內八所大學合作制定規章，開創跨領域之學位學程。未來劉副院長除繼續主持本院「永續科學研究」之外，亦已受聘為本院與國際科學理事會(ICSU)合作設立之「國際災害風險整合研究中心」(IRDR-ICoE)召集人，將致力於整合國際自然災害與防治之研究與對策。

        王惠鈞副院長(2000年當選本院院士，副院長任期2006-2011)，對擘劃本院學術方向與研究水準之提升，著力甚深。他近年對於表皮葡萄球菌與金黃葡萄球菌的優秀研究成果，深受國際矚目，並於今年接任「亞太生物化學暨分子生物科學家聯盟」會長(Federation of Asian and Oceanian Biochemists and Molecular Biologists, FAOBMB, 任期為2011-2013)。日後他將繼續擔任本院生物化學研究所特聘研究員，從事學術研究並主持國家型生技醫藥計畫及資源中心，協助規劃國家生技研究園區，以及推展亞洲太平洋地區之生物化學及分子生物學科的研究、教育與應用。並針對亞太地區的全球暖化、永續經營、經濟與貧富懸殊等問題，提倡跨學科的國際合作研究。

        現任王汎森副院長(2004年當選本院院士，副院長任期2010-)，專長為明清到近代與現代中國的思想史、學術史與文化史。王副院長積極建置並開放數位典藏資料庫供學術界使用，以及深化厚植本院明清歷史之研究，甚獲國際肯定。王副院長曾經擔任行政院國家科學委員會人文及社會科學處處長（2000-2002）、諮議委員(2003-)，本院蔡元培人文社會研究中心主任( 2003-2004)、歷史語言研究所所長（2003-2009），並榮獲傑出人才發展基金會「傑出人才講座」(1998-2003)以及英國皇家歷史學會會士(2005)。以及擔任教育部學術審議委員會委員(2003-)、漢學研究中心委員會指導委員(2004-)、以及學術交流基金會董事(2008-) 。王副院長未來對本院人文與科技之整合研究，以及推動永續發展將繼續扮演非常重要的角色。

        新任彭旭明副院長(1998年當選本院院士)專長無機化學與結晶學。他在過渡金屬錯合物的合成及結構等方面具有開創性的研究成果。他曾經擔任國立臺灣大學化學系教授(1980-)、系主任(1987-1990)與副校長(1999-2002)、本院化學研究所代理所長(1985-1987)、學術諮詢總會執行祕書及院長特助、以及日本分子科學研究所訪問教授(1991)。彭旭明副院長獲得的學術榮譽包括：德國宏博學者(1983)、教育部國家講座(1997)、發展中世界科學院化學獎(TWAS, 2002)及該院院士(2003)、台法科技獎(2008)、英國皇家化學會會士(2009)、以及日本錯體化學會國際獎(2011)。彭副院長對本院事務及高等教育相當熟悉，對推動國際合作及本院與臺大及其他研究型大學之合作將有相當幫助。

        新任陳建仁副院長(1998年當選本院院士)專長流行病學、公共衛生以及預防醫學。他在飲水砷中毒與病毒致癌的研究，深受國際重視。他曾經帶領臺灣衛生醫療行政與研究團隊，打勝數場極為艱困的流行疾病嚴苛戰役，受到全民敬重。他曾經擔任國立臺灣大學公共衛生學院院長(1999-2002)、行政院衛生署署長(2003-2005)、以及行政院國家科學委員會主任委員(2006-2008)。陳副院長並曾經榮獲美國流行病學學院院士(1993) 、傑出人才發展基金會傑出人才講座(1995-1999)、教育部國家講座(1999-2002)、總統科學獎(2005)、發展中世界科學院院士(2005)、蒙古科學院名譽院士(2007)、以及法國教育部學術棕櫚勳章(2009)。陳副院長對我國科技及衛生政策之制訂與執行有深入的瞭解及歷練，對本院往後之發展及我國生技與科技發展，將能貢獻所長。