行政院國家科學委員會為培育青年研究人員，獎助國家未來學術菁英長期投入學術研究，並紀念吳大猷先生對發展科學與技術研究之貢獻，自91年起辦理「吳大猷先生紀念獎」，獲獎人除獲頒獎牌外，另核給年度研究經費新台幣30萬元。94年度本院獲獎人及其專題研究計畫分述如下：

　社會所副研究員汪宏倫：「當代中國民族主義的制度形構與社會
　　　　　　　　　　　　　基礎：從官方到民間，從中心到邊陲」
　經濟所副研究員張俊仁：「管理（政治）型工會與經濟成長」
　統計所助研究員鄭少為：「針對具有定性及定量因子的設計所發展
　　　　　　　　　　　　　之最小偏差準則」