強化蛋白質酵素的活性是生物科技研究的嚴峻挑戰，傳統方法仰賴大規模的篩選平台和生化活性驗證。有鑑於此，本院生物化學研究所吳昆峯助研究員研究團隊率先套用先進的人工智慧深度學習工具 ProteinMPNN 加速蛋白質工程的作業流程。該團隊使用泛素為例子，通過 ProteinMPNN 計算並重新設計成一種針對 Rsp5 E3 連接酶的泛素變種。此變種是 Rsp5 專屬的有效變構活劑（allosteric activator），實驗從設計到功能驗證僅在短短三個月內完成，且無需任何人工修正設計內容，這一里程碑預示人工智慧驅動蛋白質設計的新時代到來。此研究成果已於本（112）年 8 月發表在《美國化學學會合成生物學專刊》（ACS Synthetic Biology）。

論文全文： https://pubs.acs.org/doi/10.1021/acssynbio.3c00042